En el primero y segundo piso del edificio funcionaron las habitaciones de los oficiales de la Armada.
La escalera es uno de los ejes centrales del edificio. Hasta 1979, comunicaba sus cuatro niveles: los lugares de reclusión ubicados en las plantas superiores y los cuartos de tortura o de trabajo forzado localizados en el Sótano. Por aquí, eran subidos y bajados constantemente los detenidos-desaparecidos, engrillados y encapuchados. El paso de los detenidos por las escaleras en simultáneo con los oficiales alojados en las habitaciones de este lugar, es una marca de la connivencia de la Armada con los hechos ocurridos.